Glykomimetika – společná laboratoř
Naše laboratoř ve spolupráci s kolegy z Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i. jsme založili Společnou laboratoř - Glykomimetika, která je zaměřena na rozvoj interdisciplinárního výzkumu na rozhraní chemie sacharidů, strukturní biologie a medicinální chemie. Tato spolupráce propojuje expertízu v oblasti stereoselektivní syntézy komplexních sacharidových derivátů a glykomimetik s pokročilými metodami NMR spektroskopie, strukturní analýzy a biochemického studia interakcí protein–ligand.
Hlavním cílem společné laboratoře je návrh a vývoj biologicky aktivních glykomimetik schopných selektivně modulovat interakce mezi sacharidy a proteiny, které hrají klíčovou roli v procesech, jako jsou zánět, fibróza, nádorová onemocnění a regulace imunitní odpovědi. Kombinací syntetické chemie, strukturní charakterizace a biologického testování vytváří tato laboratoř platformu umožňující plynulý přechod od molekulárního návrhu až k funkčnímu hodnocení nových sloučenin.
Joint Laboratory Team
Principal Investigators
- Radek Pohl (IOCB of the CAS) – Principal Investigator
- Kamil Parkan (University of Chemistry and Technology, Prague) – Principal Investigator
Team Members
- Jan Choutka – Postdoctoral Researcher, virtual screening and molecular modelling
- Ondřej Orság – PhD Student, synthesis of glycomimetics
- Petr Pachl – Research Scientist, structural biology and protein preparation
- Jakub Zýka – Postdoctoral Researcher, synthesis of glycomimetics
Additional Collaborations at IOCB Prague
The Joint Laboratory actively collaborates with several research groups at the Institute of Organic Chemistry and Biochemistry of the Czech Academy of Sciences and provides specialized expertise in carbohydrate synthesis and glycomimetic design for a broad range of interdisciplinary projects.
Current collaborations include, for example:
- Jiří Jiráček & Lenka Žáková – development of stable ligands for the CI-M6P/IGF2R receptor, which plays an important role in pathological and neurodegenerative processes.
- Hector Martinez-Seara – preparation of selectively sulfonated derivatives of L-iduronic acid for computational and biophysical studies.
The laboratory is open to new collaborations within IOCB Prague, especially in projects where the synthesis of complex carbohydrates and structure-guided ligand design can contribute to solving current research challenges.