Prosím počkejte chvíli...
stdClass Object
(
    [nazev] => Ústav chemie přírodních látek
    [adresa_url] => 
    [api_hash] => 
    [seo_desc] => 
    [jazyk] => 
    [jednojazycny] => 
    [barva] => modra
    [indexace] => 1
    [obrazek] => 
    [ga_force] => 
    [cookie_force] => 
    [secureredirect] => 
    [google_verification] => UOa3DCAUaJJ2C3MuUhI9eR1T9ZNzenZfHPQN4wupOE8
    [ga_account] => UA-10822215-3
    [ga_domain] => 
    [ga4_account] => G-VKDBFLKL51
    [gtm_id] => 
    [gt_code] => 
    [kontrola_pred] => 
    [omezeni] => 0
    [pozadi1] => 
    [pozadi2] => 
    [pozadi3] => 
    [pozadi4] => 
    [pozadi5] => 
    [robots] => 
    [htmlheaders] => 
    [newurl_domain] => 'uchpl.vscht.cz'
    [newurl_jazyk] => 'cs'
    [newurl_akce] => '[cs]'
    [newurl_iduzel] => 
    [newurl_path] => 8548/4164/945
    [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
    [iduzel] => 945
    [platne_od] => 31.10.2023 17:11:00
    [zmeneno_cas] => 31.10.2023 17:11:58.270512
    [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
    [canonical_url] => 
    [idvazba] => 2155
    [cms_time] => 1715177605
    [skupina_www] => Array
        (
        )

    [slovnik] => stdClass Object
        (
            [logo] => 
            [aktualizovano] => Aktualizováno
            [autor] => Autor
            [drobecky] => Nacházíte se: VŠCHT PrahaFPBTÚstav chemie přírodních látek 
            [more_info] => více informací
            [top_search_placeholder] => hledat...
            [social_fb_odkaz] => 
            [social_fb_title] => 
            [social_tw_odkaz] => 
            [social_tw_title] => 
            [social_yt_odkaz] => 
            [social_yt_title] => 
            [paticka_budova_a_nadpis] =>  BUDOVA A
            [paticka_budova_a_popis] => Rektorát, oddělení komunikace, pedagogické oddělení, děkanát FCHT, centrum informačních služeb
            [paticka_budova_b_nadpis] =>  BUDOVA B
            [paticka_budova_b_popis] => Věda a výzkum, děkanát FTOP, děkanát FPBT, děkanát FCHI, výpočetní centrum, zahraniční oddělení, kvestor
            [paticka_budova_c_nadpis] =>  BUDOVA C
            [paticka_budova_c_popis] => Dětský koutek Zkumavka, praktický lékař, katedra ekonomiky a managementu, ústav matematiky
            [paticka_budova_1_nadpis] =>  NÁRODNÍ TECHNICKÁ KNIHOVNA
            [paticka_budova_1_popis] =>  
            [paticka_budova_2_nadpis] =>  STUDENTSKÁ KAVÁRNA CARBON
            [paticka_budova_2_popis] =>  
            [paticka_adresa] =>  VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum
[paticka_odkaz_mail] => mailto:Ondrej.Simak@vscht.cz [logo_href] => / [google_search] => 001523547858480163194:u-cbn29rzve [stahnout] => Stáhnout [adresa_url] => [zobrazit_kalendar] => zobrazit kalendář [charakteristika] => Charakteristika [vice] => → více [uplatneni] => Uplatnění [studijni_plan] => Studijní plán [mene] => → méně [navaznosti] => Navazující studium v oborech [studijni_plan_povinne_predmety] => Povinné předměty [studijni_plan_volitelne_predmety] => Povinně volitelné předměty [vyucuje_se_na_ustavech] => Bližší informace na adresách: [api_obor_druh_B] => Bakalářský studijní obor [api_obor_druh_N] => Navazující magisterský studijní obor [api_obor_druh_D] => Doktorský studijní obor [dokumenty_kod] => Kód [dokumenty_nazev] => Název [dokumenty_platne_od] => Platné od [dokumenty_platne_do] => Platné do [paticka_mapa_alt] => [intranet_odkaz] => http://intranet.vscht.cz/ [intranet_text] => Intranet [logo_mobile_href] => / [logo_mobile] => [mobile_over_nadpis_menu] => Menu [mobile_over_nadpis_search] => Hledání [mobile_over_nadpis_jazyky] => Jazyky [mobile_over_nadpis_login] => Přihlášení [menu_home] => Domovská stránka [zobraz_desktop_verzi] => zobrazit plnou verzi [zobraz_mobilni_verzi] => zobrazit mobilní verzi [fakulta_FPBT_odkaz] => http://fpbt.vscht.cz/ [fakulta_FPBT] => Fakulta potravinářské a biochemické technologie [den_kratky_6] => so [novinky_kategorie_1] => Akce VŠCHT Praha [novinky_kategorie_2] => Důležité termíny [novinky_kategorie_3] => Studentské akce [novinky_kategorie_4] => Zábava [novinky_kategorie_5] => Věda [novinky_archiv_url] => Archiv novinek [novinky_servis_archiv_rok] => Archiv z roku [novinky_servis_nadpis] => Nastavení novinek [novinky_dalsi] => /novinky [den_kratky_0] => ne [den_kratky_1] => po [den_kratky_5] => pá [archiv_novinek] => Archiv novinek [paticka_mapa_odkaz] => [nepodporovany_prohlizec] => Ve Vašem prohlížeči se nemusí vše zobrazit správně. Pro lepší zážitek použijte jiný. [den_kratky_4] => čt [den_kratky_3] => st [den_kratky_2] => út [preloader] => Prosím počkejte chvíli... [novinky_archiv] => [social_in_odkaz] => [hledani_nadpis] => hledání [hledani_nenalezeno] => Nenalezeno... [hledani_vyhledat_google] => vyhledat pomocí Google [social_li_odkaz] => [novinka_publikovano] => Publikovano: [novinka_datum_konani] => Datum konani: ) [poduzel] => stdClass Object ( [1877] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [1878] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 1878 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [1879] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 1879 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [1880] => stdClass Object ( [obsah] => [iduzel] => 1880 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [iduzel] => 1877 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) [1883] => stdClass Object ( [obsah] => [poduzel] => stdClass Object ( [23616] => stdClass Object ( [nazev] => Aktuality a zajímavosti [seo_title] => Aktuality a zajímavosti z Ústavu chemie přírodních látek [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] => [urlnadstranka] => [iduzel] => 23616 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz/1883/23616 [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/1883/aktuality [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_novinky [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [1884] => stdClass Object ( [nazev] => Ústav chemie přírodních látek [seo_title] => Vítejte na stránkách Ústavu chemie přírodních látek [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Ústav chemie přírodních látek se v pedagogické i vědecké práci pohybuje na pomezí organické chemie, biochemie, biologie a chemie potravinářské i analytické. Spojnicí je zaměření na biologicky aktivní přírodní látky, modifikaci jejich struktur směrem k získání nových vlastností, analýzu přírodních látek i studium toho, co se s nimi děje v živém organismu.

Vychováváme absolventy

  • bakalářského studia programu Biochemie a biotechnologie, specializace Přírodní látky a léčiva,
  • magisterského studijního programu Přírodní látky a léčiva, specializace Chemie přírodních látek,
  • doktorského studijního programu Biochemie a bioorganická chemie.

V těchto oborech působíme jako školitelé závěrečných prací a školíme i studenty jiných studijních programů: Biotechnologie léčiv, Syntéza a výroba léčiv a Forenzní analýza.

Předměty, které vyučují naši pedagogové, jsou zařazeny do studijních plánů dalších programů na Fakultě potravinářské a biochemické technologie a jako volitelné si je mohou vybrat i studenti ostatních fakult VŠCHT Praha.

Ve vědecké práci se zaměřujeme na zajímavá a aktuální témata, na kterých spolu s námi pracují i studenti od 2. ročníku studia jako studentské vědecké síly:

  • Chemie sacharidů a glykomimetik
  • Chemie steroidů a biologicky aktivních látek
  • Chemie triterpenoidních supramolekul
  • Ligandy pro buněčné rozpoznávání
  • Vývoj nanosenzorů pro sledování patogenních procesů
  • Analytické a bioanalytické metody
  • Forenzní analýza biologicky aktivních látek
  • Molekulové modelování

Spolupracujeme s řadou ústavů VŠCHT Praha ale i s Akademií věd České republiky, Přírodovědeckou fakultou Univerzity Karlovy, Českou zemědělskou univerzitou v Praze, Jihočeskou univerzitou v Českých Budějovicích a dalšími špičkovými institucemi, domácími i zahraničními. Spolu s Ústavem organické chemie a Ústavem analytické chemie VŠCHT Praha jsme vybudovali Laboratoř forenzní analýzy biologicky aktivních látek. Studentská NMR laboratoř je společný projekt s Ústavem organické chemie.

Studovat chemickou podstatu přírodních dějů je veliké dobrodružství, které nabízíme sdílet tak, jak si jej sami užíváme.

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 1884 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /home [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [6203] => stdClass Object ( [nazev] => Spolupráce [seo_title] => Spolupráce [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Jsme otevřeni spolupráci jak na společných grantových projektech, tak formou zakázek.

Našim partnerům nabízíme:

  • syntéza speciálních chemikálií z oblasti přírodních látek a jejich analog
    • steroidy a další terpenoidy
    • porfyriny
    • flavonoidy
    • sacharidy
    • glykosidy, C-glykosidy
    • neizotopově značené sloučeniny

 

  • příprava protilátek, imunogenů, tracerů a dalších komponent imunoanalytických metod
  • strukturní analýza
  • kvantitativní analýza
  • poradenství při vypracování syntetických postupů
  • poradenství při vypracování analytických metod
  • speciální chemikálie a Imunochemikálie z našich knihoven

[iduzel] => 6203 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz/spoluprace [skupina_www] => Array ( ) [url] => /spoluprace [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [6202] => stdClass Object ( [nazev] => Studium [seo_title] => Studium [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => [obrazek] => A.jpg [ogobrazek] => [pozadi] => [obsah] =>

Nabízíme vzdělání ve všech stupních VŠ studia na Fakultě potravinářské a biochemické technologie

I studenti jiných studijních programů u nás pracují na svých bakalářských a diplomových pracích

  • Biotechnologie léčiv
  • Syntéza a výroba léčiv
  • Forenzní analýza

 Vychováváme absolventy, kteří mají hluboké teoretické znalosti a praktické zkušenosti, které jsou dnes nutným předpokladem získání perspektivního zaměstnání. Uplatnit se mohou 

  • ve výzkumných, vývojových, kontrolních a analytických laboratoří,
  • na vědeckých a vysokoškolských pracovištích,
  • ve výrobních podnicích chemických, potravinářských a farmaceutických,
  • v biochemických laboratořích a nemocnicích,
  • ve státní správě a celní službě,
  • i jako samostatně podnikající subjekty.
[urlnadstranka] => [iduzel] => 6202 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /studium [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [6205] => stdClass Object ( [nazev] => O ústavu [seo_title] => O ústavu [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Studovat chemickou podstatu přírodních dějů je veliké dobrodružství, které nabízíme sdílet tak, jak si jej sami užíváme.

Ústav chemie přírodních látek je součástí Fakulty potravinářské a biochemické technologie.

Učíme ve všech stupních vysokoškolského studia.

Bádáme ve všech oblastech spjatých s přírodními látkami.

Studenti se podílejí na řešení vědeckých projektů a stávají se spoluautory publikací a patentových přihlášek. Vysíláme je i na konference a nutíme je do zahraničních stáží.

Pracovníci našeho ústavu jsou známi tím, že studenty považují za spolupracovníky a zakládají si na individuálním přístupu k nim.

Studenti mohou pracovat na ústavu jako studentské vědecké síly a získávat prezentační dovednosti na studentské vědecké konferenci (SVK).

Rádi přijímáme ke stážím zahraniční studenty.

Naši absolventi pracují na prestižních pozicích.

[iduzel] => 6205 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz/ustav [skupina_www] => Array ( ) [url] => /ustav [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [6204] => stdClass Object ( [nazev] => Věda a výzkum [seo_title] => Věda a výzkum [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Vědecké zaměření ústavu

Hledání nových sloučenin s novými vlastnostmi.

Inspirací jsou biologicky aktivní přírodní látky.

 

 

Chemie steroidů a biologicky aktivních látek

Prof. RNDr. Pavel Drašar, DSc., EurChem, CChem, CSci, FRSC

Medicinální chemie přírodních látek

Ing. Michal Jurášek, Ph.D.

Analytické a bioanalytické metody

Prof. Dr. RNDr. Oldřich Lapčík 

Diagnostické a terapeutické nanosystémy

RNDr. Miroslav Ledvina, Ph.D.

Chemie triterpenoidních supramolekul

Prof. Ing. Zdeněk Wimmer, DrSc.

Strukturní analýza a molekulární modelování

Doc. Dr. Ing. Ivan Raich

Biologicky aktivní látky a forezní analýza

Ing. Martin Kuchař, Ph.D.

Chemie sacharidů a glykomimetik

doc. Ing. Kamil Parkan, Ph.D.

 

 
[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 6204 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /veda-a-vyzkum [sablona] => stdClass Object ( [class] => boxy [html] => [css] => [js] => $(function() { setInterval(function () { $('*[data-countdown]').each(function() { CountDownIt('#'+$(this).attr("id")); }); },1000); setInterval(function () { $('.homebox_slider:not(.stop)').each(function () { slide($(this),true); }); },5000); }); function CountDownIt(selector) { var el=$(selector);foo = new Date; var unixtime = el.attr('data-countdown')*1-parseInt(foo.getTime() / 1000); if(unixtime<0) unixtime=0; var dnu = 1*parseInt(unixtime / (3600*24)); unixtime=unixtime-(dnu*(3600*24)); var hodin = 1*parseInt(unixtime / (3600)); unixtime=unixtime-(hodin*(3600)); var minut = 1*parseInt(unixtime / (60)); unixtime=unixtime-(minut*(60)); if(unixtime<10) {unixtime='0'+unixtime;} if(dnu<10) {unixtime='0'+dnu;} if(hodin<10) {unixtime='0'+hodin;} if(minut<10) {unixtime='0'+minut;} el.html(dnu+':'+hodin+':'+minut+':'+unixtime); } function slide(el,vlevo) { if(el.length<1) return false; var leva=el.find('.content').position().left; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; var cislo=leva/sirka*-1; if(vlevo) { if(cislo+1>pocet) cislo=0; else cislo++; } else { if(cislo==0) cislo=pocet-1; else cislo--; } el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka}); el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected'); el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected'); return false; } function slideTo(el,cislo) { if(el.length<1) return false; var sirka=el.width(); var pocet=el.find('.content .homebox').length-1; if(cislo<0 || cislo>pocet) return false; el.find('.content').animate({'left':-1*cislo*sirka}); el.find('.slider_puntiky a').removeClass('selected'); el.find('.slider_puntiky a.puntik'+cislo).addClass('selected'); return false; } [autonomni] => 1 ) ) [6206] => stdClass Object ( [nazev] => Kontakt [seo_title] => Kontakt [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [obsah] =>

Ústav chemie přírodních látek, FPBT, VŠCHT Praha 

k (+420) 220 444 260

Technická 5      

166 28 Praha 6

 

 

šířka 215px

Vedoucí ústavu

 

Prof. Dr. RNDr. Oldřich Lapčík

k (+420) 220 444 448

Oldrich.Lapcik@vscht.cz

webové stránky 

CV

místnost BS18

 ◳ Obrázek1 (jpg) → (šířka 450px)

Tajemník ústavu

šířka 215px

Sekretářka a hospodářka ústavu

Doc. Ing. Kamil Parkan, Ph.D.

Irena Dražilová

k (+420) 220 444 265

k (+420) 220 444 260

Kamil.Parkan@vscht.cz

Irena.Drazilova@vscht.cz

webové stránky

 

CV

budova A, místnost A246

místnost A244

[urlnadstranka] => [iduzel] => 6206 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /kontakt [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_submenu [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [10504] => stdClass Object ( [nazev] => [seo_title] => Mapa stránek [seo_desc] => [autor] => [autor_email] => [obsah] => [iduzel] => 10504 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz/sitemap [skupina_www] => Array ( ) [url] => /sitemap [sablona] => stdClass Object ( [class] => sitemap [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [10947] => stdClass Object ( [nazev] => Přístup odepřen (chyba 403) [seo_title] => Přístup odepřen [seo_desc] => Chyba 403 [autor] => [autor_email] => [perex] => [ikona] => zamek [obrazek] => [ogobrazek] => [pozadi] => [obsah] =>

Nemáte přístup k obsahu stránky.

Zkontrolujte, zda jste v síti VŠCHT Praha, nebo se přihlaste (v pravém horním rohu stránek).

[urlnadstranka] => [iduzel] => 10947 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error403] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_ikona [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [1485] => stdClass Object ( [nazev] => Stránka nenalezena [seo_title] => Stránka nenalezena (chyba 404) [seo_desc] => Chyba 404 [autor] => [autor_email] => [obsah] =>

Chyba 404

Požadovaná stránka se na webu (již) nenachází. Kontaktuje prosím webmastera a upozorněte jej na chybu.

Pokud jste změnili jazyk stránek, je možné, že požadovaná stránka v překladu neexistuje. Pro pokračování prosím klikněte na home.  

Děkujeme!

[urlnadstranka] => [ogobrazek] => [pozadi] => [iduzel] => 1485 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[error404] [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 1883 [canonical_url] => //uchpl.vscht.cz/1883 [skupina_www] => Array ( ) [url] => /[cs]/1883 [sablona] => stdClass Object ( [class] => stranka_novinky [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) [519] => stdClass Object ( [nadpis] => [data] => [poduzel] => stdClass Object ( [61411] => stdClass Object ( [nadpis] => [apiurl] => https://studuj-api.cis.vscht.cz/cms/?weburl=/sis [urlwildcard] => cis-path [iduzel] => 61411 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => /sis [sablona] => stdClass Object ( [class] => api_html [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) ) ) [iduzel] => 519 [canonical_url] => [skupina_www] => Array ( ) [url] => [sablona] => stdClass Object ( [class] => [html] => [css] => [js] => [autonomni] => ) ) ) [sablona] => stdClass Object ( [class] => web [html] => [css] => [js] => [autonomni] => 1 ) [api_suffix] => )

DATA


stdClass Object
(
    [nadpis] => 
    [apiurl] => https://studuj-api.cis.vscht.cz/cms/?weburl=/sis
    [urlwildcard] => cis-path
    [sitemapno] => 
    [newurl_domain] => 'uchpl.vscht.cz'
    [newurl_jazyk] => 'cs'
    [newurl_akce] => '/sis/program/22310/AD104'
    [newurl_iduzel] => 
    [newurl_path] => 1/4111/959/8547/4161/1398/8548/4168/4169/8547/4156/1394/8548/39341/39376/8548/48364/48365/8548/43892/43893/8548/39341/39375/8548/38914/38915/8548/29628/29629/8548/43413/8548/28158/28159/8548/24136/24137/8548/28861/28894/8548/25669/25670/8548/20508/20509/8548/22498/22499/8548/4162/1338/8548/15102/15103/8548/10022/10023/8548/4163/1558/8548/4164/945/8548/4165/1404/8548/4168/1410/8548/5338/5339/8548/6214/6522/8548/6996/6998/8548/7924/7930/8548/7924/7930/7941/8548/7922/7926/8548/4167/1406/8548/11349/11351/1/12984/12985/8548/42398/42399/8547/11265/11271/8547/4154/1408/8547/4160/1399/8547/4156/1393/1/4111/942/8547/4161/1397/8547/4159/1395/1/1401/13358/519/61411
    [newurl_path_link] => Odkaz na newurlCMS
    [iduzel] => 61411
    [platne_od] => 29.10.2021 16:18:00
    [zmeneno_cas] => 29.10.2021 16:20:22.679723
    [zmeneno_uzivatel_jmeno] => Jan Kříž
    [canonical_url] => 
    [idvazba] => 72838
    [cms_time] => 1715177906
    [skupina_www] => Array
        (
        )

    [slovnik] => Array
        (
        )

    [poduzel] => Array
        (
        )

    [sablona] => stdClass Object
        (
            [class] => api_html
            [html] => 
            [css] => 
            [js] => 
            [autonomni] => 1
        )

    [api_suffix] => program/22310/AD104
    [html] => 

Bioinformatics

Bioinformatics

Doktorský program, Fakulta chemické technologie

The aim of the DSP programme is to educate specialists in bioinformatics, which is a combination of molecular and cell biology, biochemistry, statistics and computer science. Bioinformatics deals with the development of tools for the management of biological databases, algorithms for the processing of molecular-biological data and methods for the analysis and interpretation of relationships in these data. Most of the projects are biologically oriented with the aim to understand the complex context in the studied biological phenomena. However, we also run IT-oriented topics that include the development of algorithms or data processing methods.

Uplatnění

The combination of the education in natural sciences and informatics qualifies graduates to work in interdisciplinary teams. Graduates will find employment in a wide range of areas where data obtained by instrumental analysis of biological samples are processed. Graduates can also rely on a broad knowledge of informatics and can be successful in the development of software technologies, especially for data analytics. Graduates will further find employment in scientific infrastructures built in the Czech Republic within the framework of European operational programs. Due to the persisting lack of experts with an interdisciplinary education, graduates will also be easily employable outside the Czech Republic. Typical positions that DSP Bioinformatics graduate can hold: - researcher in basic or applied research in the public or private sector in the fields of biomedicine, clinical medicine, medical and pharmaceutical chemistry, food, agriculture, biotechnology or forensic science. Typical positions are postdoc, programmer, research associate, research fellow, project leader, project manager. - university lecturer in bioinformatics, computational biology, computational chemistry or applied informatics. Typical positions are assistant professor, assistant, lecturer. - software developer or data analyst in IT companies. - professional positions that require organizational and analytical skills and expertise not only in bioinformatics. Typical job positions include state administration at the highest management levels, organizations that are methodologically and organizationally engaged in science and research or non-profit and educational organizations.

Detaily programu

Jazyk výuky anglický
Standardní doba studia 4 roky
Forma studia prezenční
Garant studia prof. Mgr. Daniel Svozil, Ph.D.
Místo studia Praha
Kapacita 8 studentů
Kód akreditace (MŠMT kód) P0588D030002
VŠCHT kód AD104
Počet vypsaných témat 4

Vypsané disertační práce pro rok 2021/22

Biologické strojové učení

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.
Ústav informatiky a chemie
Školitel: Mgr. Tomáš Pluskal, Ph.D.

Anotace


Naše laboratoř kombinuje špičkové experimentální (např. LC-MS, metabolomika, RNA-seq) a výpočetní (např. Bioinformatika, molekulární sítě, strojové učení) přístupy k vývoji rychlých, obecně použitelných pracovních postupů pro objevování a využívání bioaktivních molekul odvozených z rostlin. Hledáme talentované a motivované výpočetní výzkumníky, kteří by se připojili k našemu týmu. Úspěšným kandidátem na tuto pozici bude vývoj modelů pro predikci enzymatických aktivit enzymů v biosyntetických drahách. Vzhledem k interdisciplinární povaze laboratoře bude tento projekt prováděn v úzké spolupráci s experimentálními výzkumníky, kteří budou generovat data pro trénink a ověřování modelu.
kontaktujte vedoucího práce Místo výkonu práce: Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha

Celogenomové mapování míst tvorby genotoxických meziproduktů vznikajících při kolizích replikačních a transkripčních komplexů

Garantující pracoviště: Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i.
Ústav informatiky a chemie
Školitel: RNDr. Jana Dobrovolná, Ph.D.

Anotace


Bylo zjištěno, že aktivované onkogeny v lidských přednádorových lézích způsobují zastavení a kolaps replikačních vidlic, což vede ke genetické nestabilitě a vývoji rakoviny. Navrhovaný projekt ověřuje hypotézu, že replikační stres vyvolaný aktivací onkogenů je důsledkem interference mezi transkripcí a replikací způsobující tvorbu RNA:DNA hybridů, které mají genotoxické účinky. Náplní projektu je za spolupráce biologů s bioinformatiky: (i) identifikovat místa v genomu, kde se tvoří R-smyčky v podmínkách onkogeny indukovaného replikačního stresu; (ii) určit základní charakteristiky těchto míst; (iii) zjistit, zda aktivace onkogenů je spojena s tvorbou RNA:DNA hybridů ve fragilních úsecích chromosomů, jenž preferenčně vykazují nestabilitu za těchto podmínek; (iv) zjistit, zda se místa tvorby R-smyček překrývají s místy genomových translokací a deleci detekovaných ve zhoubných nádorech.
kontaktujte vedoucího práce Místo výkonu práce: Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha

Genetická rekombinace a reprodukční izolace na modelu Mus musculus

Garantující pracoviště: Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i.
Ústav informatiky a chemie
Školitel: prof. MUDr. Jiří Forejt, DrSc.

Anotace


Cílem navrhovaného dizertačního projektu je objasnit epistatické interakce PRDM9 histon metyltransferázy s X-vázaným genetickým faktorem Hstx2 v meiotické rekombinaci a samčí neplodnosti mezi-poddruhových hybridů. Naše laboratoř identifikovala Prdm9 jako první gen obratlovců, který se účastní reprodukční izolace mezi druhy. PRDM9 protein predeterminuje meiotické rekombinační hotspoty uvnitř druhu k zajštění crossing-overů, chromozomálního párování a diferenciace pohlavních buněk, ale u mezdruhových hybridů tentýž gen zapřičiňuje meiotickou zástavu a hybridní sterilitu prostřednicvím persistence DNA dvojřetězcových zlomů, poruchy rekombinace a následnou poruchou párování chromozomů. Proces je modulován Hstx2 genetickým faktorem lokalizovaným v 2.7 Mb intervalu chromozomu X. Hlavním úkolem projektu je identifikovat genomickou sekvenci odpovědnou za Hstx2 efekt s použitím panelu bioinformatických nástrojů pro mRNA expresní profilování pomocí Next generation RNA sequencing (RNA-seq), pro sekvenaci imunoprecipitovaného chromatinu (ChIP-seq) a pro mapování lokusů kvantitativních znaků (QTL).
kontaktujte vedoucího práce Místo výkonu práce: Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha

Výpočetní hmotnostní spektrometrie

Garantující pracoviště: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.
Ústav informatiky a chemie
Školitel: Mgr. Tomáš Pluskal, Ph.D.

Anotace


Naše laboratoř kombinuje špičkové experimentální (např. LC-MS, metabolomika, RNA-seq) a výpočetní (např. Bioinformatika, molekulární sítě, strojové učení) přístupy k vývoji rychlých, obecně použitelných pracovních postupů pro objevování a využívání bioaktivních molekul odvozených z rostlin. Hledáme talentované a motivované výpočetní výzkumníky, kteří by se připojili k našemu týmu. Úspěšným kandidátem na tuto pozici bude vývoj nové generace platformy MZmine (https://mzmine.github.io) pro zpracování dat hmotnostní spektrometrie v metabolomice. Mimo jiné se snažíme přidat k MZmine plnou podporu pro iontovou pohyblivou spektroskopii (IMS) a zlepšit její schopnosti molekulárních sítí. Doporučují se zkušenosti s programováním v Javě.
kontaktujte vedoucího práce Místo výkonu práce: Ústav informatiky a chemie, FCHT, VŠCHT Praha
)

VŠCHT Praha
Technická 5
166 28 Praha 6 – Dejvice
IČO: 60461373
DIČ: CZ60461373

Datová schránka: sp4j9ch

Copyright VŠCHT Praha 2014
Za informace odpovídá Oddělení komunikace, technický správce Výpočetní centrum
zobrazit plnou verzi